Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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