Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms