Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms