Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms