Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms