Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms