Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms