Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms