Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOMO3P69849 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOMO3P69849 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms