Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms