Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CLDN17P56750 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CLDN17P56750 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CLDN17P56750 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CLDN17P56750 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CLDN17P56750 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CLDN17P56750 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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