Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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