Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms