Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms