Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A4P31645 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms