Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms