Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms