Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms