Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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