Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms