Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR1BP28222 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR1BP28222 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms