Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGB2P26583 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB2P26583 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms