Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRCP23327 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRCP23327 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRCP23327 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRCP23327 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms