Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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