Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms