Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
GP1BBP13224 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GP1BBP13224 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms