Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms