Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCAP01258 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCAP01258 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCAP01258 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCAP01258 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms