Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms