Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF879B4DU55 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF879B4DU55 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF879B4DU55 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF879B4DU55 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF879B4DU55 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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