Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms