Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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