Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms