Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms