Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms