Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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