Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms