Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms