Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRIT1Q9P2V4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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