Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNFX1Q9P2E3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNFX1Q9P2E3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNFX1Q9P2E3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNFX1Q9P2E3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNFX1Q9P2E3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNFX1Q9P2E3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNFX1Q9P2E3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms