Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms