Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms