Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms