Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms