Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms