Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms