Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms