Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms