Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOL6Q9BWW8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms