Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms